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如果华为nova手机来短信时不显示在最上面，可以尝试以下方法解决问题。
1、检查手机设置：确保没有在手机的通知管理中关闭短信应用的通知权限，进入手机的设置，找到“通知管理”或“应用管理”，确保短信应用的通知权限已开启。
2、重启短信应用：有时候应用会出现暂时性的问题，可以尝试重启短信应用，看看是否能够解决问题。
3、清理缓存和数据：有时候应用缓存过多或者数据出现问题也会导致应用运行不正常，可以尝试清理短信应用的缓存和数据。
4、检查短信设置：确保没有在短信设置中关闭通知栏显示，进入手机的短信设置，查看是否有相关选项可以开启。
5、更新系统或应用：如果手机系统或短信应用版本过旧，可能会导致一些功能不正常，可以尝试更新系统或短信应用到最新版本。
6、检查是否有其他应用冲突：有些应用可能会与短信应用冲突，导致短信不显示在最上面，可以尝试关闭其他应用，只开启短信应用，看看是否能够解决问题。
如果以上方法都无法解决问题，建议联系华为客服或到华为售后服务中心寻求帮助。